Hodnotiaca komisia bola zriadená opatrením ministra vnútra. Jej hlavnými úlohami je posudzovať predložené reformné zámery a prijímať rozhodnutia o nich. Zložená je z viacerých členov z rôznych inštitúcií:
- generálna riaditeľka sekcie európskych programov MV SR – predsedníčka komisie,
- generálny riaditeľ sekcie verejnej správy MV SR – podpredseda komisie,
- generálny riaditeľ sekcie informatiky, telekomunikácií a bezpečnosti MV SR,
- riaditeľ odboru OP EVS sekcie európskych programov MV SR,
- vedúci oddelenia implementácie projektov odboru OP EVS sekcie európskych programov MV SR, tajomník komisie,
- zástupca Úradu splnomocnenca vlády SR pre rozvoj občianskej spoločnosti,
- zástupca Ministerstva investícií, regionálneho rozvoja a informatizácie Slovenskej republiky,
- zástupca Ministerstva financií Slovenskej republiky,
- zástupca Úradu vlády Slovenskej republiky,
- zástupca Ministerstva spravodlivosti Slovenskej republiky,
- zástupca Finančného riaditeľstva Slovenskej republiky,
- zástupca Združenia miest a obcí Slovenska.
